Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPUQ71F23 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPUQ71F23 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPUQ71F23 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms