Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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