Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms