Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms