Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.5 ms