Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHC4Q6S5L8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms