Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms