Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK5Q6P3R8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms