Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms