Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC70Q6NSX1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms