Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPRIN2Q6IMN6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms