Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX8Q68G74 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms