Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN13Q68D06 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN13Q68D06 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN13Q68D06 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN13Q68D06 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN13Q68D06 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN13Q68D06 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN13Q68D06 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN13Q68D06 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN13Q68D06 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms