Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG16L1Q676U5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms