Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms