Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP135Q66GS9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP135Q66GS9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CEP135Q66GS9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP135Q66GS9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms