Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RNF123Q5XPI4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RNF123Q5XPI4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms