Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms