Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUD1Q5VV17 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms