Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms