Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF20Q5VTR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms