Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38BQ5VTL8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms