Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B1Q5TIE3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VWA5B1Q5TIE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA5B1Q5TIE3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms