Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF648Q5T619 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF648Q5T619 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms