Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BEND3Q5T5X7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BEND3Q5T5X7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms