Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN11Q5T124 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBXN11Q5T124 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms