Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms