Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms