Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIA9

CBWD5, COBW domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD5Q5RIA9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBWD5Q5RIA9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBWD5Q5RIA9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms