Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FFAR4Q5NUL3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FFAR4Q5NUL3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms