Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTSL3PQ5NE16 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms