Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3AQ59EK9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms