Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A12Q504Y0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms