Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP13A4Q4VNC1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms