Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC153Q494R4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.2 ms