Protein–RNA interactions for Protein: Q3YEC7

RABL6, Rab-like protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL6Q3YEC7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABL6Q3YEC7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABL6Q3YEC7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABL6Q3YEC7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABL6Q3YEC7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABL6Q3YEC7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABL6Q3YEC7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RABL6Q3YEC7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABL6Q3YEC7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABL6Q3YEC7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABL6Q3YEC7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABL6Q3YEC7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms