Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF1Q3BBV0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NBPF1Q3BBV0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms