Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRK1Q38SD2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRK1Q38SD2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms