Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UVSSAQ2YD98 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UVSSAQ2YD98 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms