Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms