Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC57Q2TAC2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms