Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC142Q17RM4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
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