Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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