Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPTX1Q15818 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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