Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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