Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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RCN1Q15293 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RCN1Q15293 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN1Q15293 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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