Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKD1Q15139 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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