Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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