Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7AQ13946 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PDE7AQ13946 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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