Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
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